“三區革命”是在國內外形勢影響下，在蘇聯的支持和進步知識分子領導下的新疆各族人民反對盛世才和國民黨反動統治的民族解放運動。
    所謂“三區”是指當時新疆的伊犁、塔城和阿爾泰三個地區。引發革命爆發的導火線是盛世才、國民黨強迫人民的“獻馬運動”。
    1943年3月，國民黨政府發布命令要求各族人民捐獻1萬匹軍馬，交不出馬，則按高出市場價格一倍的馬價交納現金。1944年8月，鞏哈縣(今尼勒克縣)牧民首先發動了武裝起義，他們占領了鞏哈縣城，由此拉開了三區革命的序幕。不久，游擊隊分兵幾路攻占伊寧城，11月12日，成立“東突厥斯坦共和國”臨時政府，組成16人的臨時政府委員，推舉艾列汗·吐烈為政府主席。艾力汗·吐烈是一個狂熱的泛伊斯蘭主義者，所以，三區革命初期，臨時政府領導權控制在宗教上層封建勢力手中。直到阿合買提江、阿巴索夫等掌握領導權后才作了扭轉。至1945年初，革命軍打敗了國民黨增援部隊，攻占了伊犁境內幾個據點，整個伊犁地區均被游擊隊占領。同年3月，三區民族軍正式成立。6月初，在蘇聯軍事顧問幫助下，民族軍制定了向北線解放塔城、阿山兩專區；向中線以精河為目標，進而向迪化挺進；南線至南疆開展游擊戰，牽制國民黨軍隊的作戰計劃。在民族軍的攻勢下，至9月間，塔城、阿山區相繼解放，北線、中線取得勝利成果。民族軍進抵瑪納斯河兩岸，距迪化城僅150公里。在此同時，新疆其他七區相繼爆發多次反對國民黨的武裝起義，南線作戰的民族軍一度攻占拜城、溫宿等城，一部分塔吉克族和柯爾克孜族組成游擊隊攻克蒲犁縣(今塔什庫爾干塔吉克自治縣)，并成立了革命政府。   
    1945年8月14日，日本宣布無條件投降，八年抗戰結束，同一天《中蘇友好同盟條約》在莫斯科簽字。國民黨政府承認外蒙古獨立，出于本國邊境安全考慮，蘇聯政府愿意作為調停者，促使三區與國民黨政府談判。另一方面，新疆國民黨，駐軍糧食給養不足，已不是三區民族軍的對手，隨著抗戰結束，國內外和平的呼聲越來越強烈，蔣介石不得不改變策略，派遣張治中到新疆同三區革命政府進行和平談判。所以，國內外局勢和新疆形勢的變化是導致三區革命政府與國民黨政府舉行和平談判的基礎。1945年10月，以阿合買提江為首的三區革命政府的代表與國民黨政府的代表在迪化舉行和平談判，經過三個月交鋒，迫使國民黨政府不得不做出讓步，雙方達成協議。翌年1月，雙方代表簽訂11項和平條款，根據條款規定，改組新疆省政府，成立由三區革命代表、七區代表和國民黨中央代表共同組成的新疆省聯合政府，張治中任新疆省聯合政府主席，阿合買提江、包爾漢任副主席，阿巴索夫任副秘書長。在新疆省聯合政府成立的前夜，已執掌三區革命領導權的阿合買提江、阿巴索夫等取消了“東突厥斯坦共和國”的名稱，改稱為新疆伊犁專區政府，并糾正了三區革命初期的一系列錯誤，拋棄了“東突厥斯坦”的旗號，團結新疆各族人民，使革命走上正確軌道。   
    1946年，隨著國民黨反動派發動內戰，破壞和平，新疆的國民黨政府當局不顧各族人民的堅決反對，阻撓和平條款的實施，迫害民主人士，向三區發動進攻，導致新疆省聯合政府破裂，以阿合買提江為首的三區革命代表于1947年7～8月間返回伊寧。